Theo báo cáo của các địa phương, một số thiệt hại bước đầu do cơn bão số 3 thống kê đến 7h00 ngày 13/9 như sau:
Về người: 336 người chết, mất tích (233 người chết, 103 người mất tích), tăng 36 người chết (Lào Cai 16, Cao Bằng 9, Yên Bái 6, Tuyên Quang 3, Vĩnh Phúc 1, Phú Thọ 1) so với báo cáo ngày 11/9.

Trong đó: Lào Cai: 179 người (98 người chết, 81 người mất tích), gồm: Bảo Yên 110, Sa Pa 9, Bát Xát 17, Si Ma Cai 7, Bắc Hà 34, Văn Bàn 2.

Cao Bằng: 52 người (43 người chết, 9 người mất tích).
Yên Bái: 50 người (48 người chết, 02 người mất tích), gồm: TP Yên Bái 21, Lục Yên: 14, Văn Yên 9, Văn Chấn 2, Trấn Yên 4.
Quảng Ninh: 15 người chết.
Hải Phòng: 2 người chết do bão.
Hải Dương: 1 người chết do bão.
Hà Nội: 1 người chết do bão.
Hòa Bình: 7 người chết do sạt lở đất.
Lạng Sơn: 3 người chết do lũ cuốn, sạt lở đất.
Bắc Giang: 2 người chết do lũ cuốn.
Tuyên Quang: 5 người chết do lũ.
Hà Giang: 2 người (1 người chết; 1 người mất tích).
Lai Châu: 1 người chết do sạt lở đất.
Vĩnh phúc: 2 người chết do lũ.
Phú Thọ: 11 người (1 người chết do sạt lở đất; 1 người chết do lũ; 8 người mất tích tại sự cố sập cầu Phong Châu; 1 người mất tích do lũ).
Sơn La: 1 người mất tích do lũ cuốn.
Thái Nguyên: 2 người chết do lũ.
Số người bị thương: 823 người, trong đó: Quảng Ninh 536, Hải Phòng 49, Hải Dương 5, Hà Nội 23, Bắc Giang 7, Bắc Ninh 52, Hà Giang 1, Lạng Sơn 10, Lào Cai 76, Yên Bái 30, Cao Bằng 17, Phú Thọ 7, Bắc Kạn 3, Hoà Bình 3, Vĩnh Phúc 2, Thanh Hoá 2.
Sơ tán tổng 74.536 hộ/130.246 người di dời (Tuyên Quang 4.957; Hà Giang 82, Điện Biên 3, Sơn La 165, Bắc Kạn 232, Phú Thọ 5.785, Thái Nguyên 25.821, Lào Cai 7.792, Hoà Bình 1.765, Thanh Hoá 10, Bắc Ninh 655, Bắc Giang 13.022, Hà Nam 1.757, Hải Dương 824, Hưng Yên 114, Hà Nội 716, Thái Bình 1.577, Nam Định 1.738, Hải Phòng 5, Ninh Bình 7.516).
Nhà hư hỏng: 136.705 nhà (tăng 6.437 nhà). Trong đó: Quảng Ninh 70.629, Hải Phòng 40.005, Bắc Ninh 3.472, Lạng Sơn 2.990, Bắc Giang 3.289, Yên Bái 1.378,...; nhiều cửa hàng, trụ sở, trường học bị tốc mái, hư hỏng; rất nhiều biển hiệu quảng cáo, cột viễn thông, trạm phát sóng di động bị gẫy đổ; cây xanh đô thị bị thiệt hại.
Nhà bị ngập: 67.653 nhà (tăng 9.796 nhà). Trong đó: Hà Giang 664, Lào Cai 3.017, Yên Bái 21.451, Sơn La 296, Tuyên Quang 18.698, Lạng Sơn 6.945, Thái Nguyên 5.000, Bắc Kạn 217, Quảng Ninh 6, Hà Nội 6.521, Nam Định 959, Ninh Bình 3.674, Thanh Hoá 205).
Về nông nghiệp: 202.094 ha lúa bị ngập úng, thiệt hại (tăng 6.165ha). Trong đó Hải Phòng 23.870ha; Nam Định 33.268ha; Thái Bình 5.000ha; Hà Nội 27.318ha; Hưng Yên 2.012ha; Hải Dương 20.467ha; Hà Nam 7.928ha; Bắc Giang 18.779ha;…
39.298 ha hoa màu bị ngập úng, thiệt hại (tăng 5.288ha); tập trung tại Hải Phòng 5.116ha; Hải Dương 3.159ha; Bắc Giang 1.981ha; Hoà Bình 6.728ha; Phú Thọ 1.631ha; Lạng Sơn 1.849ha,...
22.288 ha cây ăn quả bị hư hại (tập trung tại Hải Phòng 2.043ha; Thái Bình 1.385ha; Hà Nội 3.924ha; Hưng Yên 2.953ha; Hải Dương 3.163ha; Bắc Giang 6.669ha,…).
1.848 lồng bè nuôi trồng thuỷ sản bị hư hỏng, cuốn trôi (tập trung Quảng Ninh 1.000, Hải Dương 300,...).
4.594 con gia súc, 1.786.872 con gia cầm bị chết (tập trung ở Hải Dương 388.605, Hải Phòng 713.303 gia cầm; Thái Nguyên 292.696,…). Các địa phương đang tiếp tục rà soát, thống kê thiệt hại.